תכנית הלימודים כוללת קורסי חובה, קורסי בחירה, סמינריונים וקורסים באנגלית. במסגרת הלימודים ילמדו קורסים בחשבונאות פיננסית, קורסים בחשבונאות ניהולית ושיטות כמותיות, קורסים בכלכלה ומימון, קורסים משפטיים וקורסי מיסים, קורסי ביקורת ואנגלית עסקית. תלמיד במרכז יקבל את תכנית הלימודים במועדים שייקבעו לכך על ידי הנהלת המרכז. באנגלית, בתרגולים ובקורסי הבחירה שיתקיימו, יקבע המרכז באיזה קורס ישתתף התלמיד.
במסגרת התואר הסטודנטים יקחו חלק ב
קורס המערכת החשבונאית. קורס זה נועד להקנות לסטודנטים כלים ראשוניים במסגרת לימודי החשבונאות, במטרה להקל עליהם את הלימודים בקורסים המתקדמים. בדרך זו מתאפשרת כניסה נוחה לתחום החשבונאות גם לסטודנטים שאינם בעלי רקע מוקדם בנושא זה.
כמו כן, המרכז האקדמי שערי מדע ומשפט מציע לימודי
שנת השלמה - שנת לימודים רביעית - המיועדת להכנה לבחינות מועצת רואי חשבון בישראל, כפי שמקובל באוניברסיטאות.